综合管理办公室主要协助中心主任开展日常工作。负责中心人力资源管理、财务管理、科研团队管理、实验设备申购、维修及管理，负责收集整理发布协同创新中心相关信息、交流服务，协助科研项目管理及对科研项目的绩效评估等相关管理服务工作。组织召开年度工作进展汇报会，形成中心年报，内容涵盖中心重要活动与科研进展，并将年报向理事会及专家咨询委员会报送。